מהי בדיקת ריצוף ביופסיה נוזלית NGS Liquid Trace וכיצד היא מסייעת באיתור ממצאים גנומיים?
במעבדת GTC, קליפורניה, ארה"ב
מאושרת תקני CLIA וCAP, התקנים המחמירים הנדרשים ע"פ הFDA
הבדיקה מספקת המלצות לטיפולים ביולוגים ואימונותרפיים מאושרי FDA או מחקריים, טיפולים שאינם יעילים, והפניה למחקרים קליניים.
הבדיקה מספקת מידע על MRD להערכת שארית מחלה, ברמת רגישות גבוהה של 0.01%.
*עומק קריאה גבוה במיוחד של 25,000-30,000X חזרות.
*זמן לתוצאות כ – 10 ימי עבודה מרגע הגעת הדגימה למעבדה.
הגרף מציג עליה של 22.4% במספר המוטציות שניתן לזהות בריצוף cfRNA לעומת cfDNA
לינק לפרסום ASCO 2022 Poster
נתונים עיקריים מבדיקת GTC – Liquid Trace
- ריצוף מקיף של DNA - ריצוף cfDNA של 302 גנים לכל סוגי השינויים הגנומיים, בכיסוי כל האקסונים.
-
ריצוף מקיף של RNA - ריצוף cfRNA - טרנסקריפטום ממוקד ל-1,600 גנים, המאפשר:
- איתור ביומרקרים דיאגנוסטיים ופרוגנוסטיים.
- עלייה של 23% באיתור ממצאים גנומיים
- יתרון בזיהוי Fusions ו- Alternative Splicing.
- אנליזת T & B Cell clonality המסייעת בחיזוי התנהגות הגידול.
- Homologous Recombination Repair (HRR).
- מדד TMB להתאמה לאימונותרפיה.
- איתור שינויים בגן DPYD לצורך התאמת מינון בתרופה 5FU/קסלודה.
- סיוע באיתור שארית מחלה Minimal Residual Disease (MRD) – ברמת רגישות של – VAF (Varient Allele Frequency) = 0.01%
- אפיון HLA להתאמה למחקרים וכפרדיקציה לתגובה לטיפול אימונותרפי.
- דיוק מקסימאלי – עומק קריאה 25000-30000X חזרות.
- רגישות הבדיקה- LoD (Limit of Detection) = 0.01-0.001% for hotspots and 0.1-0.01% for non-hotspots, במקרים בהם ידוע מקור הגידול ויש היסטוריה אונקולוגית מוקדמת- LoD = 0.001%.
- הפקת תוצאות הבדיקה- QNS<1% for DNA
- שימוש במערכת בינה מלאכותית מתוחכמת (AI) לפרשנות ודיווח ממצאים.
מידע על המעבדה תעודות ואישורים
פרסומים ומאמרים
- CSF LB – ESMO 2025
- ctDNA detectionin in CSF and plasma and mutational concordance with the primary tumor in patients with glioma (ESMO 2025 - Ann. Oncol.)
- Prevalence of the HPV, EBV and TTV viral RNA in the plasma of patients with solid and hematologic neoplasms (ASCO Poster 2025)
- Limited Changes in the CNS Immune Microenvironment in Patients with Breast Cancer Metastasis to CNS (ASCO Poster 2025)
- CSF LB for evaluating mutations and chromosomal aberrations in patients with primary or metastatic CNS tumors (JBL 2024)
- Transcriptome and Machine Learning Predict GVHD from Pre/Post-Transplant Bone Marrow Samples_(Cancers 2024)
- Liquid Biopsy for Evaluating mutations and chromosomal aberrations in CSF for CNS Primary or CNS Metastasis (JBL 2024)
- Expanding the Clinical Utility of Liquid Biopsy using AI-Based Transcriptome_(JBL 2024)
- cfRNA + cfDNA Liquid Biopsy utility in Hematologic and Solid Tumors (Heliyon 2023)
- Differential Diagnosis of Hematological and Solid Tumors using AI-Based Transcriptome_ (amjpathol.2022)
- ESMO Guidelines on ctDNA Use in Precision Oncology_ (ESMO 2022)
