שילוב מידע גנומי עם כימותרפיה מותאמת אישית – מחקרים ותוצאות משמעותיות

שילוב מידע גנומי עם כימותרפיה מותאמת אישית - מחקרים ותוצאות משמעותיות ​

A. במחקר על 60 מטופלים עם גידולים סולידיים מתקדמים (בינהם: לבלב, סרקומה, ריאות, שד, שחלה, וושט, כליה, ראש צוואר, מעי ועוד) המטופלים קיבלו טיפול מותאם משולב של:

  1. Angiogenesis inhibitors בהתאם לשינוי גנומי שאותר בבדיקת NGS (איור מס’ 1).
  2. ובנוסף טיפול כימותרפי הנמצא מתאים לתאי הגידול בבדיקה פונקציונאלית.

תוצאות:

  • 95% מהמטופלים הראו תגובה לטיפול שקיבלו (PR / SD).
  • mPFS = 5 months (95%, CI: 4.1-5.8).
  • mOS= 8.9 months (95%, CI: 7.3-10.6).
  • לא נצפו תופעות לווי ב Grade IV.
  • כל המטופלים היו בקווי טיפול מתקדמים, יחס pfs2:pfs1 נמצא גדול מ 1.6 (ובחלק מהמקרים גבוה יותר)
השינויים הגנומיים שאותרו ונכללו במחקר כהתאמה לטיפול ב Angiogenesis inhibitors.

איור 1: השינויים הגנומיים שאותרו ונכללו במחקר כהתאמה לטיפול ב Angiogenesis inhibitors.

B. במחקר על 49 מטופלים בעלי גידולים סולידיים מתקדמים (בינהם: לבלב, סרקומה, ריאות, שד, שחלה, וושט, כליה, ראש צוואר, מעי ועוד), המטופלים קיבלו טיפול מותאם ומשולב של:

  1. mTOR inhibitors בהתאם לשינוי גנומי שאותר בבדיקת NGS, / Temsirolimus  Everolimus (איור מס’ 2).
  2. ובנוסף טיפול כימותרפי הנמצא מתאים לתאי הגידול בבדיקה פונקציונאלית
    או טיפול ביולוגי ממוקד בהתאם לתוצאות הריצוף הגנומי.

תוצאות עיקריות:

  • 91.8% מהמטופלים הראו תגובה לטיפול שקיבלו (CR/ PR / SD).
  • mPFS = 4.9 months (95%, CI: 3.6-6.2).
  • mOS= 9.4 months (95%, CI: 6.6-12.2).
  • לא נצפו תופעות לווי ב Grade IV.
  • כל המטופלים היו בקווי טיפול מתקדמים, יחס pfs2:pfs1 נמצא גדול מ 1.8.
השינויים הגנומיים שאותרו ונכללו במחקר כהתאמה לטיפול ב mTOR inhibitors.

איור 2: השינויים הגנומיים שאותרו ונכללו במחקר כהתאמה לטיפול ב mTOR inhibitors.

תוצאות אלו מדגימות כיצד שימוש במידע גנומי בשילוב עם בחירת כימותרפיה מותאמת אישית, מוביל לתוצאות משמעותיות.

ניבוי יעילות כימותרפיה ונתוני שימושיות קלינית מתוך מחקר רחב של מעל 5,000 דגימות

ניבוי יעילות כימותרפיה ונתוני שימושיות קלינית מתוך מחקר רחב של מעל 5,000 דגימות ​

שיטת איתור התאים והייצוג של הגידול ומיקרו-סביבת הגידול

תאי הגידול Circulating Tumor-Associated Cells (C-TACs) מאותרים מתוך ה PBMC, ובאמצעות מדיום ייחודי epigenetically activating media (Cell Wizard™) עוברים תהליך הגורם להרג של תאים בעלי מנגנון אפופטוטי מתפקד, בעוד שהתאים הממאירים העמידים לאפופטוזיס יישרדו.

לאחר 5 ימי חשיפה למדיום, התאים עוברים איפיון אימונו-פלורוצנטי לנוגדנים כגון DAPI, EPCAM, CK and CD45 – תאים אלו מייצגים את הגידול ואת התאים בסביבת הגידול המגוייסים לתפקד כחלק מהגידול, בעיקר מקרופאג’ים ופיברובלסטים.

במחקר שפורסם על 5,090 דגימות של חולי סרטן עם גידולים סולידיים שונים מהם נלקחו דגימות דם ובודדו C-TACs, עלו הממצאים הבאים:

  1. תאימות של 97% בין התגובה לטיפול בקו ראשון לזו שנצפתה בתוצאות הבדיקה.
  2. ב- 61% מהמטופלים הנאיביים נצפתה עמידות לטיפול אחד או יותר, מתוך הטיפולים המומלצים עבורם בהנחיות.
  3. תאימות של 87% בין עמידות לטיפול בפועל לעמידות שנצפתה בבדיקה, בקווי טיפול מתקדמים.
  4. נמצא כי דגימות C-TACs (ביופסיה נוזלית) נמצאו בקורלציה של 93.7% לדגימות ריקמה מבחינת פרופיל העמידות לטיפול.

>>> לינק למאמר שימושיות קלינית

>>> לינק למאמר ולידציה טכנולוגית על שיטת איתור התאים הייחודית ודיוקה

בדיקת  ChemoScale (CLIA, CAP)

איתור תאי גידולי מוח בזרם הדם (CGC’s) והערכת תגובת התאים לתרופות ציטוטוקסיות

איתור תאי גידולי מוח בזרם הדם (CGC's) והערכת תגובת התאים לתרופות ציטוטוקסיות ​

מאמר ולידציה ליכולת איתור ובידוד תאי CGC's מזרם הדם

חדירת תרופות ציטוטוקסיות למוח

עדכון על זמינות בדיקת PolE סטנד-אלון, באמצעות ריצוף גנטי עמוק NGS

עדכון על זמינות בדיקת PolE סטנד-אלון, באמצעות ריצוף גנטי עמוק NGS

מצורף עדכון על מחקר PORTEC3 והכללת ריצוף PolE באלגוריתם של ה-NCCN, כחלק מהסיווג הפתולוגי.

הבדיקה מבוצעת במעבדת GTC ארה”ב, מאושרת CLIA, CAP לפי דרישות ה- FDA.

רקע

עד כה סיווג פתולוגי של גידולי אנדומטריאל, כלל בדיקת IHC של  P53 ו-MSI .

במחקר PORTEC3 עלו הממצאים שלהלן:

RFS- RT Only

36%

76%

97%

RFS - CT+RT

59%

68%

100%

Biomarker

P53 abnormal

dMMR

PolE

בדיקת PolE

סיווג פתולוגי עבור גידולי Endometrial Carcinoma (Uterine Neoplasms_NCCN_p.28)
סיווג פתולוגי עבור גידולי Endometrial Carcinoma (Uterine Neoplasms_NCCN_p.28)

בדיקת MGMT מדוייקת עבור חולי GBM וגידולי מוח אחרים, כחלק מבדיקת ריצוף מלאה.

בדיקת MGMT מדוייקת עבור חולי GBM וגידולי מוח אחרים, כחלק מבדיקת ריצוף מלאה. ​

אנו מציעים את בדיקת MGMT, ללא עלות נוספת, למטופלים המופנים אלינו לבדיקת ריצוף מקיפה (מפרט הבדיקה מצורף מטה).

>>> לינק לדוח תוצאות לדוגמא

>>> לינק למידע נוסף ופרסומים של בדיקת הריצוף

מפרט בדיקת הריצוף המלאה הכוללת בדיקת MGMT על רקמת הגידול

ביומרקרים חדשים בבדיקות ריצוף

ביומרקרים חדשים בבדיקות ריצוף ​

ריצוף 1600 גנים של FOLR1 ,RNA ועוד ​

עדכון על הרחבות משמעותיות בבדיקות הריצוף, המאפשרות יותר אופציות טיפוליות עבור המטופלים.
בדיקת NGS מבוססת ריקמה או דם, במעבדת GTC ארה”ב, מאושרת CLIA, CAP לפי דרישות ה- FDA.

  1. הביומרקר FOLR1 פותח אופציה טיפולית נוספת לחולות שחלה עמידות לפלטינום שעברו 1-3 קווי טיפול.
    לפי מחקר SORAYA – נמדד ORR של 7% (95% CI, 22.9%-41.6%).
    לינק למחקר Journal of Clinical Oncology.
  2. בדיקת FOLR1 ניתן לבצע כחלק מבדיקת ריצוף מקיפה או כבדיקה בודדת.
  3. ריצוף RNA 1600 גנים לאיתור ביומרקרים דיאגנוסטיים ופרוגנוסטיים, יתרון בזיהוי Fusions, Amplifications ו- Alternative Splicing.
  4. בדיקת ריצוף נוזליתהיחידה הכוללת ריצוף RNA 1600 גנים, המעלה סיכוי לממצאים ולדיוק בערך MRD.
    *הגרף בתחתית המייל מציג – עליה של 22.4% במספר המוטציות שניתן לזהות בריצוף cfRNA לעומת cfDNA. לינק לפרסום ASCO 2022 Poster
  5. איתור שינויים בגן DPYD לצורך התאמת מינון בתרופה 5-FU/קסלודה.
  6. Homologous Recombination Deficiency /Repair – HRD/HRR, להתאמת טיפול במעכבי פארפ.
  7. ביומרקרים ומדדי אימנותרפיה: DNA ויראלי HPV/EBV, TMB, MSI, PD-L1, PD-L2, PD-1, CD8 ועוד.
  8. אבחון מקור הגידול באמצעות ריצוף RNA ושימוש בבינה מלאכותית (AI) המבדילה בין 45 אבחנות של גידולים סולידיים והמטולוגיים.
    לינק לפרסום  American Journal of Pathology.  
  9. זמן לתוצאות כשבועיים – המהיר ביותר בתחום.
  10. סיכום תמציתי ויישומי לאונקולוג של עיקר הממצאים הקליניים מתוך הדוח המפורט, ותמיכה מקצועית מלאה.
  11. שירות מקיף למטופלים – הסברים מפורטים למטופל ולמשפחה לפני בדיקה ולאחריה, ובירור כל ההחזרים משב”ן וביטוחים פרטיים.

עליה של 22.4% במספר המוטציות שניתן לזהות בריצוף cfRNA  לעומת cfDNA.
לינק לפרסום ASCO 2022 Poster

קורלציה בין ביטוי PDL1 בפלסמה לתוצאות טיפול באימונתרפיה – ASTRO/ASCO

קורלציה בין ביטוי PDL1 בפלסמה לתוצאות טיפול באימונתרפיה - ASTRO/ASCO

מחקר פרוספקטיבי שפורסם לאחרונה בכנס ASTRO/ASCO הציג את הקורלציה בין ביטוי PDL1 בפלסמה לתוצאות טיפול באימונותרפיה.
תוצאות הטיפול באימונותרפיה על בסיס ממצאי PDL1 בפלסמה, היו זהות לאלו של ביטוי PDL1 בריקמה.

המחקר והמסקנות:

“A liquid PD-L1 has significant clinical utility guiding immunotherapy treatment”

המחקר מדגים את האפשרות והחשיבות של קבלת מידע על PD-L1  באמצעות ביופסיה נוזלית, למטופלים שעבורםPD-L1  הוא אינדיקציה לאימונותרפיה.
ביופסיה נוזלית מספקת מידע עדכני חשוב על
PD-L1, במקביל או לאחר בדיקה על ריקמה.

*לחצו על הלינק למידע מלא על הבדיקה – בדיקת ביופסיה נוזלית מקיפה ctDNA+ctRNA.
** אנו מסייעים בקבלת מקסימום החזרים כספיים מקופ”ח וביטוחים פרטיים, בממוצע כ- 70%.

מעבדת Circulogene: פיתחה טכנולוגיה להעשרה מוגנת פטנט, המצמצמת איבוד מידע גנטי, כך ששיטות הריצוף ו-qPCR יספקו אנליזה גנומית מלאה.
בדיקת פאנל מקיפה (88 גנים) מבוססת ctRNA ו-ctDNA כולל מדדי אימונותרפיה כגון PD-L1 ו- MSI, וכן אפשרות לבדיקת מוטציות בודדות ו- RNA fusion.
הבדיקה מאושרת CLIA, CAP.

אפשרות לבדיקה מהירה למוטציות בודדות בעלות נמוכה – בהתאם לסוג הגידול, לדוגמא:

ביופסיה נוזלית בסרטן השד – יתרונות והזדמנויות

ביופסיה נוזלית בסרטן השד - יתרונות והזדמנויות

סקירת ספרות מעודכנת ל-2021

כחלק מהמעקב שלנו אחר ההתפתחויות בתחום המולקולר והכוונת הטיפול, ערכנו סקירת ספרות עדכנית בנוגע לתפקידה של ביופסיה נוזלית בסרטן שד. מהסקירה עולה, כי נכון לתחילת 2021, ביופסיה נוזלית כבר הוכיחה יכולת לסייע בבחירת הטיפול, לנטר את התגובה לו ולצמצם טיפולים כימותרפיים.

*הממצאים מבוססים על מקורות peer-reviewed, בהם תוכלו לצפות על ידי לחיצה על הקישורים.

* לחצו על האייקון בטבלה שלמטה   - כדי לקרוא תקציר של הפסקה החשובה מתוך המאמר.  

יעד

ההזדמנות שבביופסיה נוזלית

מקור

תקציר

סיוע בבחירת טיפול
מחקר PlasmaMatch מצא שמתוך 1,044 מטופלות, ל-51.1% אותרה מוטציה עם טיפול אפשרי כנגדה באמצעות ctDNA
מחקר STIC CTC מצא כי מדידת תאי ה-CTC בדם יכולה להנחות את הבחירה בין טיפול כימותרפי והורמונלי
איתור מטרות טיפול שלא הופיעו בביופסיה מרקמה
בכ-48% מהמטופלות, CTC הוסיף מידע על המאפיינים הגנטיים של הגידול בהשוואה לביופסיית רקמה. בכ-24% נמצא הבדל בסטטוס ER. הקליניקה תמכה בתוצאות שסיפק ה-CTC

תגובה לטיפול תרופתי / ניתוחי 

מדידת רמות ctDNA לאחר טיפול יכולה לחזות את הצלחתו ואת הסיכון להתקדמות המחלה

איתור מוקדם של התקדמות

נמצא ש-ctDNA חוזה התקדמות סרטן שד גרורתי, 5 חודשים לפני הדמיה ב-89% מהמטופלות ובאופן מדויק יותר מ-CA15-3

מעקב ותגובה לשארית מחלה
באמצעות ביופסיה נוזלית ניתן לאתר MRD ולסייע בהחלטה בנוגע לטיפול אדג’ובנטי על מנת למנוע חזרה
איתור מוקדם
ניטור cfDNA יכול לשמש ככלי איתור מוקדם בנשאיות של מוטציות germline
הערכת שלב ופרוגנוזה
הצהרת קונצנזוס קבעה שביופסיה נוזלית היא כלי חשוב לקביעת שלב המחלה, גם באופן עצמאי לעומת מאפיינים קליניים ומולקולריים
סיוע בבחירת טיפול
מחקר PlasmaMatch מצא שמתוך 1,044 מטופלות, ל-51.1% אותרה מוטציה עם טיפול אפשרי כנגדה באמצעות ctDNA
מחקר STIC CTC מצא כי מדידת תאי ה-CTC בדם יכולה להנחות את הבחירה בין טיפול כימותרפי והורמונלי
איתור מטרות טיפול שלא הופיעו בביופסיה מרקמה
בכ-48% מהמטופלות, CTC הוסיף מידע על המאפיינים הגנטיים של הגידול בהשוואה לביופסיית רקמה. בכ-24% נמצא הבדל בסטטוס ER. הקליניקה תמכה בתוצאות שסיפק ה-CTC

תגובה לטיפול (תרופתי / ניתוחי)

מדידת רמות ctDNA לאחר טיפול יכולה לחזות את הצלחתו ואת הסיכון להתקדמות המחלה

איתור מוקדם של התקדמות

נמצא ש-ctDNA חוזה התקדמות סרטן שד גרורתי, 5 חודשים לפני הדמיה ב-89% מהמטופלות ובאופן מדויק יותר מ-CA15-3

מעקב ותגובה לשארית מחלה
באמצעות ביופסיה נוזלית ניתן לאתר MRD ולסייע בהחלטה בנוגע לטיפול אדג’ובנטי על מנת למנוע חזרה
איתור מוקדם
ניטור cfDNA יכול לשמש ככלי איתור מוקדם בנשאיות של מוטציות germline
הערכת שלב ופרוגנוזה
הצהרת קונצנזוס קבעה שביופסיה נוזלית היא כלי חשוב לקביעת שלב המחלה, גם באופן עצמאי לעומת מאפיינים קליניים ומולקולריים

בטבלה הבאה – כיצד ביופסיה נוזלית כבר מספקת מידע נוסף, בנוגע ליעדי טיפול נבחרים בסרטן שד.

* לחצו על האייקון בטבלה שלמטה   - כדי לקרוא תקציר של הפסקה החשובה מתוך המאמר.  

יעד

ההזדמנות שבביופסיה נוזלית

מקור

תקציר

BRCA

1. תחזית התגובה למעכבי PARP ולמלחי פלטינום במוטציות BRCA סומטיות.

ER

1. שינוי בסטטוס ER נצפה ב-24% מהמטופלות.

2. הנחיות קליניות כבר תומכות במעקב סטטוס ER לאורך הטיפול.

HER2

1. הבדל בסטטוס HER2 בין ביופסיה מרקמה לנוזלית נצפה ב-23% מהמקרים.

2. הנחיות קליניות כבר תומכות במעקב סטטוס HER2 לאורך הטיפול.

3. תחזית התגובה ל-Neratinib.

4. ניטור התגובה תחת טיפול נוגד HER2.

ESR1

בהשוואה בין אנליזת ctDNA לבין ביופסיות מאותם המטופלים, נמצא ש-ctDNA מכיל מידע רב יותר בנוגע למוטציות ESR1.

PIK3CA

1. במחקר PlasmaMATCH נמצא ש-ctDNA היא טכנולוגיית סינון
יעילה לטיפולים מכווני PIK3CA, גם במסגרת מחקרים.

2. במחקר PALOMA-3 הודגמה קורלציה של ctDNA לתגובה לטיפול ב- Palbociclib ו-Fulvestrant.

3. ב- SOLAR-1ctDNA נמצא כחוזה תגובה לטיפול במעכב- PIK3CA (Alpelisib) בנוסף ל-Fulvestrant במטופלות.

AKT1

הערכת עמידות לטיפול במעכבי AKT כגון Capivasertib.

TP53

1. הערכת עמידות לטיפול

2. תועדו מקרים של איתור היעד בביופסיה נוזלית, אך לא בריקמה.

PTEN

הערכת עמידות לטיפול Alpelisib ומעכבי ארומטז.

היעד: BRCA

ההזדמנות שבביופסיה נוזלית:

1. תחזית התגובה למעכבי PARP ולמלחי פלטינום במוטציות BRCA סומטיות.

היעד: ER

ההזדמנות שבביופסיה נוזלית:

1. שינוי בסטטוס ER נצפה ב-24% מהמטופלות.

2. הנחיות קליניות כבר תומכות במעקב סטטוס ER לאורך הטיפול.

היעד: HER2

ההזדמנות שבביופסיה נוזלית:

1. הבדל בסטטוס HER2 בין ביופסיה מרקמה לנוזלית נצפה ב-23% מהמקרים.

2. הנחיות קליניות כבר תומכות במעקב סטטוס HER2 לאורך הטיפול.

3. תחזית התגובה ל-Neratinib.

4. ניטור התגובה תחת טיפול נוגד HER2.

היעד: ESR1

ההזדמנות שבביופסיה נוזלית:

בהשוואה בין אנליזת ctDNA לבין ביופסיות מאותם המטופלים, נמצא ש-ctDNA מכיל מידע רב יותר בנוגע למוטציות ESR1.

היעד: PIK3CA

ההזדמנות שבביופסיה נוזלית:

1. במחקר PlasmaMATCH נמצא ש-ctDNA היא טכנולוגיית סינון
יעילה לטיפולים מכווני PIK3CA, גם במסגרת מחקרים.

2. במחקר PALOMA-3 הודגמה קורלציה של ctDNA לתגובה לטיפול ב- Palbociclib ו-Fulvestrant.

3. ב- SOLAR-1ctDNA נמצא כחוזה תגובה לטיפול במעכב-PIK3CA (Alpelisib) בנוסף ל-Fulvestrant במטופלות.

היעד: AKT1

ההזדמנות שבביופסיה נוזלית:

הערכת עמידות לטיפול במעכבי AKT כגון Capivasertib.

היעד: TP53

ההזדמנות שבביופסיה נוזלית:

1. הערכת עמידות לטיפול.

2. תועדו מקרים של איתור היעד בביופסיה נוזלית, אך לא בריקמה.

היעד: PTEN

ההזדמנות שבביופסיה נוזלית:

הערכת עמידות לטיפול Alpelisib ומעכבי ארומטז.

תאי גידול חופשיים ככלי פרוגנוסטי חדשני להכוונת הטיפול

תאי גידול חופשיים ככלי פרוגנוסטי חדשני להכוונת הטיפול

כידוע, רפואה מותאמת אישית בסרטן מתבססת כיום בעיקר על ריצוף של ה-DNA. בסקירה הבאה, שנכתבה בהכוונתה המקצועית של פרופ’ תמר ספרא, נדבר על כלי פרוגנוסטי חדשני שנחקר רבות בשנים האחרונות וכדאי להכיר – תאי גידול חופשיים בזרם הדם (CTC).

ביופסיה נוזלית- לא רק בסרטן ריאות

ביופסיה נוזלית- לא רק בסרטן ריאות

מחקרים רבים כבר הראו את יעילות השימוש בביופסיה נוזלית בסרטן ריאות מסוג NSCLC.
אך מה קורה בגידולים אחרים?